Geneettinen erilaisuus prosenteissa

Seuraa 
Viestejä45973
Liittynyt3.9.2015

Vähän väliä jossain ilmoitetaan, että otus A eroaa otuksesta B geneettisesti x prosenttia. Epäselväksi on jäänyt, mitä niillä prosenteilla tarkalleen ottaen tarkoitetaan. Sitäkö, että x % DNA:n emäsjärjestyksestä poikkeaa otuksilla toisistaan? Vai sitä, että sellaisia geenejä, joita ei vastaa toisella lajilla mikään samantyyppinen geeni, on x % genomista? Vai mitä ihmettä?

Vähän aikaa sitten oli Hesarin tiedesivuilla juttua banaanikärpäsestä. Artikkelissa todettiin, että ihminen ja banaanikärpänen ovat geneettisesti 70-prosenttisesti samanlaisia. Hämmentyneenä laskin, että banaanikärpäsellä hädin tuskin on geenejä 70 % ihmisen geenimäärästä. Tarkoitettiinko, että ihmisellä on kaikki banaanikärpäsen geenit ja lisäksi muita geenejä? Kuulostaa aika erikoiselta.

Lisää sekosin, kun uusin Tiede-lehti ilmestyi ja kertoi identtisten kaksosten genomien muuttumisesta iän myötä ympäristötekijöiden vaikutuksesta. Jutussa sanottiin, että 40-vuotiaiden identtisten kaksosten geeneistä jo 60 % on erilaisia.

Tällä hetkellä tiedämme siis, että geneettisesti ihminen ja simpanssi eroavat toisistaan 1,5 %, ihminen ja banaanikärpänen 30 % ja ihminen ja ihmisen identtinen kaksoisveli 60 %. Olenko ainoa, joka on lievästi sanoen päästään pyörällä?

Kommentit (10)

Vierailija
Scylla

Lisää sekosin, kun uusin Tiede-lehti ilmestyi ja kertoi identtisten kaksosten genomien muuttumisesta iän myötä ympäristötekijöiden vaikutuksesta. Jutussa sanottiin, että 40-vuotiaiden identtisten kaksosten geeneistä jo 60 % on erilaisia.

EI taida olla noin paljon erillaisia geenejä.

Vierailija

pitää muistaa että paljon tilaa dna:sta vie solunsisäiset toiminnot yms, ja se että peini ero jossain ihosolun dna:ssa on todella pieni ero % laskettuna mutta näkyvä ero voi olla todella suuri.

Vierailija

Oho, ymmärsin Tiede-lehden jutusta kohdan "dna:t poikkesivat toisistaan jo 60 prosentilla" vähän väärin. Eli korjaus alkuperäiseen kaksosjuttuun: idea taisikin olla, että 60 prosentilla tutkituista kaksospareista oli syntynyt keskenään eroavuuksia DNA:han, eikä että 60 % olisi muuttunut muuksi. :P

Edit: Silti kaipaan vielä selitystä siihen, mitä geneettisellä eroavuudella tarkalleen tarkoitetaan esimerkiksi ihmisen ja banaanikärpäsen kohdalla.

Vierailija
Scylla
Vähän aikaa sitten oli Hesarin tiedesivuilla juttua banaanikärpäsestä. Artikkelissa todettiin, että ihminen ja banaanikärpänen ovat geneettisesti 70-prosenttisesti samanlaisia. Hämmentyneenä laskin, että banaanikärpäsellä hädin tuskin on geenejä 70 % ihmisen geenimäärästä. Tarkoitettiinko, että ihmisellä on kaikki banaanikärpäsen geenit ja lisäksi muita geenejä? Kuulostaa aika erikoiselta.

Olen ymmärtänyt, että tällä tarkoitetaan sitä, että 70%:lla banaanikärpäsen geeneistä on vastine ihmisen genomissa. Toisin sanoen geenien ei tarvitse olla identtiset ja voi olla, että niiden koodaamat proteiinit toimittavat eri tehtävääkin. Esimerkiksi banaanikärpäsellä on yksi setti HOX-geenejä, mutta ihmisellä on - muistaakseni - kolme enemmän tai vähemmän täyttä settiä (ja olikohan täydessä setissä 7 HOX-geeniä).

luonnonystävä
Seuraa 
Viestejä215
Liittynyt18.3.2005

Geneettisellä erovuudella tarkoitetaan, että 70 %:lle ihmisen geenistä löytyy samanlaista toimintoa koodaava geeni baanaanikärpäsestä.

Edit: Arla kirjoitti että geenit eivät välttämättä koodaa samanlaista toimintoa. 70 % lienee siis homologisten eli yhteistä evoluutioalkuperää olevien geenien osuus.

MrKAT
Seuraa 
Viestejä2234
Liittynyt16.3.2005

Bilsan kirjoissa voidaan ilmoittaa vielä että pojalla ja äidillä on 50% geeneistä yhteisiä.. siitäkös soppa syntyy kun näyttäisi olevan hiirelle läheisempää (70%) sukua..

Geneettisen samankaltaisuuden, similaarisuuden käsitteet on tosiaan ihan täysin sekaisin populaaritasolla ja voitaisiin pyytää TIEDE-lehteen tästä selventävä artikkeli.

Minä olen ymmärtänyt että on olemassa ainakin kolmea tasoa:
1. Samat geenit,
2. Geenien samankaltaisuus,
3. Genomin (DNA:n) samankaltaisuus.

Esim.
1. Ihmisellä ja hiirellä 99% samat geenit, ihmisellä ja simpanssille ehkä 99.9% samat.
2.Ihmisellä ja simpanssilla mm. identtinen hemoglobiini (samat aminohappoketjut proteiinissa)
3.Ihmisellä ja hiirellä 80% DNA:sta samanlaista, ihmisellä ja simpanssilla 98.6% DNA:sta samanlaista.

Ja vaikka tulosproteiiniketju olisi 100% identtinen, niin sitä koodaavien DNA:n ei tarvi olla koska monet eri DNA:n kolmikot voi koodata identtisesti saman aminohapon tuohon ketjuun.

Homeopatia-skandaali A-talkissa: https://www.youtube.com/watch?v=qXLTz5LhHMU

Vierailija
Scylla
Vähän väliä jossain ilmoitetaan, että otus A eroaa otuksesta B geneettisesti x prosenttia. Epäselväksi on jäänyt, mitä niillä prosenteilla tarkalleen ottaen tarkoitetaan. Sitäkö, että x % DNA:n emäsjärjestyksestä poikkeaa otuksilla toisistaan? Vai sitä, että sellaisia geenejä, joita ei vastaa toisella lajilla mikään samantyyppinen geeni, on x % genomista? Vai mitä ihmettä?



Ihan oikeassa olet, geneettinen erilaisuus tarkoittaa hieman eri asiaa eri tilanteissa. Yritän vähän selvittää tätä alla.

Scylla
Vähän aikaa sitten oli Hesarin tiedesivuilla juttua banaanikärpäsestä. Artikkelissa todettiin, että ihminen ja banaanikärpänen ovat geneettisesti 70-prosenttisesti samanlaisia.



Tässä tapauksessa luultavasti tarkoitetaan, että 70% kärpäsen geeneistä löytyy myös ihmiseltä. Kun ihmisen genomi sekvensoitiin 2001, luku oli 61%, joten ilmeisesti se on vähän muuttunut. Jos katsotaan toisinpäin, noin 40% ihmisen geeneistä löytyy myös banaanikärpäseltä (vuoden 2001 luku taas).

Eli tässä ei ole kyse siitä kuinka hyvin DNA:n emäsparit ovat säilyneet, vaan löytyykö tietty geeni, vaikkapa laktaasi joka pilkkoo maitosokeria, ylipäätään molemmilta lajeilta. Tähän määritelmään liittyy jonkin verran teknisiä ongelmia, mutta niihin tuskin tarvitsee mennä.

Scylla
Lisää sekosin, kun uusin Tiede-lehti ilmestyi ja kertoi identtisten kaksosten genomien muuttumisesta iän myötä ympäristötekijöiden vaikutuksesta. Jutussa sanottiin, että 40-vuotiaiden identtisten kaksosten geeneistä jo 60 % on erilaisia.



En lue Tiede-lehteä, mutta luultavasti tämä viittaa pari kuukautta sitten PNAS-lehdessä ilmestyneeseen artikkeliin. Tässä tutkimuksessa ei tutkittu ollenkaan geenisekvenssien eroja emäsparien tasolla, vaan ns. epigeneettisiä muutoksia. Identtisien kaksosten DNA:ssahan ei ole nykytietämyksen mukaan ollenkaan eroja.

Epigeneettisillä muutoksilla tarkoitetaan (nykyään) mm. DNA:n metylaatiota ja histonien asetylaatiota. Histonit ovat siis proteiineja, jotka muodostavat ne X:n näköiset kromosomit yhdessä DNA:n kanssa, ja metylaatio ja asetylaatio ovat pieniä kemiallisia muutoksia. Tiivistettynä: geenien toimintaan vaikuttavat DNA:n lisäksi epigeneettiset muutokset. Identtisten kaksosten DNA:n metylaatiossa ja histonien asetylaatiossa on eroja, ja vanhemmilla kaksosilla näitä eroja on enemmän. Nämä erot taas aiheuttavat sen, että kaksosten geenien ilmentymisessä (RNA-molekyyleissä ja niiden tuottamissa proteiineissa) on eroja.

Jos Tiede-lehdessä viitattiin tähän tutkimukseen ja samalla puhuttiin eroista DNA-sekvenssissä, sitten heillä on käsitteet menneet sekaisin.

Scylla
Tällä hetkellä tiedämme siis, että geneettisesti ihminen ja simpanssi eroavat toisistaan 1,5 %, ihminen ja banaanikärpänen 30 % ja ihminen ja ihmisen identtinen kaksoisveli 60 %. Olenko ainoa, joka on lievästi sanoen päästään pyörällä?

Apinan tapauksessa tuo 1,5% (tai oikeastaan 1,23%) tarkoittaa nimenomaan eroja DNA:n emäsjärjestyksessä. Mutta jotta asiat eivät olisi liian yksinkertaisia, oikeastaan ihmisen ja apinan ero on 1,23% tai noin 4%, riippuen siitä kuinka se lasketaan ja mitä näkökulmaa halutaan painottaa...

Ei siis mitenkään ihme, että pää menee pyörälle, kun nuo luvut tarkoittavat täysin eri asioita eri yhteydessä. Toivottavasti tämä selvitys auttoi hiukan!

Vierailija

Kiitos Toaster, selvensi vähän. Saisivat silti julkaisut olla selkeämpiä sanoissaan, niin ei tarvitsisi arvuutella...

Toaster
Jos Tiede-lehdessä viitattiin tähän tutkimukseen ja samalla puhuttiin eroista DNA-sekvenssissä, sitten heillä on käsitteet menneet sekaisin.

Korjasinkin jo toisessa viestissäni mokani, itse tajusin väärin.

Vierailija

Kaivoin vanhan viestin esiin, ja haluaisin vielä selvennystä geneettiseen erilaisuuteen: kuinka suuri ero on ihmisYKSILÖIDEN välillä? Jos identtisillä kaksosilla on 100% sama genomi, millainen se on sisaruksilla tai ei-sukulaisilla?

Jos 1,23% tarkoittaa apinan emäsjärjestyksen eroavaisuutta ihmisen emäsjärjestyksestä, mikä on tämä "emäsjärjestys" johon sitä verrataan, kun kuitenkin yksilöillä on se erilainen; olemmehan erilaisia.Miten prosentti siis lasketaan? Onko siinä kyse siitä, että ihmiseltä esim. puuttuu jokin tietty pätkä kokonaan, ja tämä lasketaan "eroavaisuudeksi emäsjärjestyksessä". Onko kyse siitä, että tietty geeni on toisessa paikassa kromosomia?

Vierailija

En tiedä kuinka iso eroavaisuus ihmisyksilöillä on emäspareissa prosentualaisesti ihan tarkalleen, mutta erot geeneissä ja niiden säätelyalueilla on ihan heittäen on muutaman emäsparin tasoa. Emäsparitason muutokset sitten vaikuttaa siihen miten geenit ja niiden tuotteet ilmenevät ja niiden säätelyyn osallistuvat säätelysekvenssit ja proteiinit toimivat. Säätelyynhän osallistuu säätelysekvenssit, olosuhteet, säätelyproteiinit, DNA:n pakkautuminen, monenlaiset RNA molekyylit ym. eli aika monessa kohdassa geenien ilmentymistä voi ilmentyä eroja jolloin syntyy monenlaista tulosta. Lajien välisiin eroihin en oikein osaa ottaa kantaa tältä kannalta, koska en ole pahemmin perehtynyt.

Uusimmat

Suosituimmat