Sivut

Kommentit (74)

Sisältö jatkuu mainoksen alla
Sisältö jatkuu mainoksen alla
Minijehova
Seuraa 
Viestejä18755

Hinta on näköjään taas sen 599e tuolle perustestille. Tuli juuri selattua kun kirjasin näytettä.

Varsin tyytyväinen alehintaan ja bonarina sain omani lahjaksi, eli tuli tosi halvaksi.😋

MJ

Ville-78
Seuraa 
Viestejä17

Kiva vaan jos muutkin innostuivat omasta itsestään.. ja epäilijöille tiedoksi, että en tästä saa mitään etuja enkä palkintoja.. raha ei aja asiaa,vaan ihan muut lähtökohdat. mm.HUS:n kielteinen asenne samoja testejä kohtaan!

Mutta itse asiaan; sain ensimmäisen lisäraportin niistä maksullisista yksilöivistä testeistä ja laatu oli nyt varsin erilaista kuin alkuperäinen, joka oli tosi selkeä.  Vajaa 4vk. kesti toimitus, vaikka itse data on dl:n sivuilla.. taitaa olla pojilla paljon hommia :)
Ja muuten, jos tilaatte niitä tarkentavia raportteja ni katsokaa, että verkkokaupan tilauksessa näkyy se alkuperäinen ID,minkä pohjalta tekevät filtteröinnin. Nimittäin pari kertaa piti ränkätä kun se ei linkittänyt sitä mukaan!
-lähinnä säästää supportin kanssa välppäämisen ja turhan säätämisen, kun läpimenoajat on viikoissa.

Joka tapauksessa testi paljasti yhden useista perinnöllisistä alttiuksista.. tiesin sen olemassaolosta, mutta se on eri mitä suvussa, aika mielenkiintoista? 
No ,nyt voin ennakoida tätäkin ja säästää vuosia ihmettelyssä. Lääkevasteet voidaan kohdistaa paremmin, kun/jos geenit sitten aktivoituvat ja autoimmuunisairaus iskee päälle.Tiedä vaikka lääkäri pystyisi näiden tietojen pohjalta parantamaan ennustetta ja räätälöidä henkilökohtaista hoitoa.

Nämä ovat sitten lähes mahdottomia käydä suoraan datasta läpi ilman automatiikkaa, sillä nämä mutaatiot ovat variantteja, eli useampi geenikohta vaikuttaa lopputulokseen. Kyllä/ei vastaukset ei enää riitä. Mitä useammissa on alttius, sitä todennäköisempää on ongelma.. ks.kuva
Itseasiassa myös kieli on muuttunut tekniseksi, eikä  ole enää yleisselkoista englantia,viestin lopussa yksi varianteista.

Autoimmuunisairausraportt on 11 sivua pitkä ja hyvin kyllä haettu tarkasti ne kohdat, eli on täysin tarkistettavissa, jos vaikka tutkimustieto joskus paranee tai muuttuu tarkentuvaksi.

*********************************************************************

rs41295061 - NC_000010.11:g.6072697C>A
In an analysis of 5,312 individuals with type 1 diabetes (IDDM10; 601942) and 6,855 controls, Lowe et al. (2007) found that a SNP in the IL2RA gene,
ss52580101, was the most associated SNP in a 40-kb region encompassing IL2RA intron 1 and the 5-prime regions of IL2RA and RBM17 (606935) (P =
3.37 x 10(-20)). The submitted SNP ss52580101 has been assigned the refSNP identifier rs41295061.

ja tuolta tutkimustuloksen virallinen tieto:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=17676041
---raportissa on suorat linkit--

Minijehova
Seuraa 
Viestejä18755

Dantelabsin tulokset tulivat ja ensimmäinen huomio genomistani oli että olen allerginen etanolille geneettisellä tasolla. Tuon olinkin jo huomannut arjessa, mutta kiva saada geneettinen vahvistus.

MJ

Minijehova
Seuraa 
Viestejä18755

Muutaman tunnin pikavilkaisulla on kyllä hyvä genomi osunut kohdalle.

Vaatii vuosien lisäajoa, mutta genetiikka ei minua ensimmäisenä petä, sen voi jo vilkaisulla sanoa.

Tulipahan projektia...😍

MJ

Minijehova
Seuraa 
Viestejä18755

Olen vasta hiljalleen availemassa avaajan antamaa linkkilistaa datan käsittelyyn, sillä jotenkin innostuin testaamaan kuinka nopeasti opin itse käyttämään dataa.

Aloitin puolen tunnin verran etsiäkseni itsestäni wikitiedoista alkaen, eli: In humans, the CCR5 gene that encodes the CCR5 protein is located on the short (p) arm at position 21 on chromosome 3.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene

Tuolta saa tarkan sijainnin, kaikki nimet ja ilmenemismudot geeniin kuin geeniin, mutta raakadatasta delta32-muunnoksen näkemisessä on yhä lieviä alkuhankaluuksia. :)

Katsotaan kauan menee että tuota oppii lukemaan silmällä kunhan syöttää ensin oikeat koordinaatit. Ja eri kromosomeihin jakautuneet yhteistoiminnot kuulostavat erityisen työläiltä työstettäviltä.

Hauska harrastus vuosiksi 170 eurolla ja kiistatta sekvensointi on jo antanut moninkertaisen vastineen rahalle jo terveysmielessä. Harrastetunnit taas ovat mittaamattoman arvokkaita jo oppimisen vuoksi.

MJ

Minijehova
Seuraa 
Viestejä18755

Nyt on käyty läpi kolmasosa yhdeksästä SIRT6 kopiosta, FOXO3 kaksi kopiota todettu alatyypiksi FOXO3a ja etenkin sieltä on löytynyt jo kymmenkunta SNP:tä, jotka ennustavat hyvää elinikää, SIRT6:sta muutama aivan erinomainen tunnettu muunnos paikallistettuna. CETP:n kaksi kopiota odottavat läpitarkastusta ja sen jälkeen ovat vuorossa CDKN2B, ABO, SH2B3 ja SOD3.

Käsityönä on hidasta, mutta varsinainen data on läppiksen levyllä, johon sopiva kotelo usbilla on vasta postissa. Koneelta ajaminen lienee pirusti käsin kaivamista nopeampaa, mutta käsityössä tuntuu oppivan samalla paremmin perusteita, ei pelkästään näe tunnettuja löydöksiä. Monta SNP:tä ilman googleosumia on jo tullut genomista vastaan, sekä muutamia tunnettuja, mutta joiden vaikutuksia ei ole vielä onnistuttu liittämään mihinkään.

Ns. longevitygeeneistä on kyllä osunut kiva pakka, sillä käytännössä jokainen löydös on positiivinen tai sitten toistaiseksi tuntematon. Kaikki elinikään negatiivisesti vaikuttavat alleelit loistavat poissaolollaan (toistaiseksi).

Kun listataan positiivisesti eliniänodotteeseen vaikuttavia alleeleja, löytyy minulta nähtävästi koko tunnettu top10 optimimuodoissaan. Nice. 

MJ

Minijehova
Seuraa 
Viestejä18755

APOE unohtui selatuista.
https://www.snpedia.com/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene

Noista saa hyvää koordinaattia ja tunnettuja SNP variaatioita assosiaatioineen.

Kuvaan Dantelabsin oma gene explorer näkymä kromosomista 19 kohdasta, jossa SIRT6 sijaitsee. Zoomilla tai koordinaateilla sitten tarkistaa kunkin SNP:n erikseen noista kahdesta linkatusta ja muutamasta muusta databasesta.

Tägään aina paikallistetun, tarkastetun ja varmistetun SNP:n ja lasken kunkin geenin koon ja liitän asianmukaiset linkit tageihin.

Menee hujahtaen sellaisia kuusituntisia selaussessioita, mutta on kyllä nautinnollista tekemistä.😋

MJ

Minijehova
Seuraa 
Viestejä18755

Vuosi sitten about ylittyi miljoonan raja koko genomin sekvensoinneissa ja kuulemani arvio parin viikon takaa oli n. 10 miljoonaa globaalisti.

Kehtaa sanoa olevansa etulinjassa kun kuuluu ensimmäiseen sekvenssointuun promilleen.

On muuten taas tarjousta Dantelabsilla, 229€ 30x ajo koko genomista. Hyvä hinta! Normi 599€.

Datamäärän kasvaessa sen arvo nousee.

MJ

Sivut

Suosituimmat

Uusimmat

Sisältö jatkuu mainoksen alla

Suosituimmat